Situation de l’influenza aviaire en France au 06/02/2017 (20h00)

Marie-Cécile Moisson (1), Anne Van De Wiele (2), Jean-Baptiste Perrin (1), Anne Bronner (1)*, Audrey Schmitz (3), Eric Niqueux (3), Claire Martenot (3), François-Xavier Briand (3), Didier Calavas (4)*, Sophie Le Bouquin-Leneveu (5), Adeline Huneau-Salaün (5)

(1) DGAl, (2) ONCFS, (3) Unité Virologie, Laboratoire national de référence, Anses-Ploufragan, (4) Anses-Lyon, (5) Unité Epidémiologie aviaire, Anses-Ploufragan,*Coordination Plateforme ESA

Les résultats présentés ci-après sont basés sur les foyers notifiés au système ADNS ou à l'OIE au 6 février 2017, 20h00.

Depuis le 28 novembre 2016 (date de déclaration du premier cas d'IAHP), 203 foyers d'influenza aviaire hautement pathogène (IAHP) ont été détectés en élevage dont 167 foyers d'IAHP attribués au virus H5N8 et 36 foyers d'IAHP H5Nx (la neuraminidase n'ayant pu être identifiée), soit 36 foyers d'IAHP supplémentaires déclarés depuis le dernier point de situation au 23 janvier 2017. Toujours en élevage, trois foyers supplémentaires d'influenza aviaire faiblement pathogène (IAFP) ont été déclarés depuis le dernier point de situation, soit un total de 28 foyers d'IAFP. Par ailleurs, huit cas supplémentaires d'IAHP ont été détectés dans l’avifaune libre, portant le nombre total de cas à 17, et un cas supplémentaire d'IAFP a été détecté chez des oiseaux captifs, dans un élevage de gibiers.

(Tableau 1)

Tableau 1 : Répartition des foyers (élevages) et des cas (avifaune) déclarés d'influenza aviaire réglementée selon l'espèce et le sous-type (entre le 28/11/2016 et le 06/02/2017 à 20h00)

Pathogénicité Sous-type Volailles domestiques Avifaune captive Avifaune libre
Galliformes Multi-espèces Palmipèdes Total
HP H5 3 1 32 36   5
H5N8 23 13 131 167 1 12
Total HP 26 14 163 203 1 17
FP H5     6 6    
H5N1 1 1 11 13    
H5N2       0 1  
H5N3     2 2    
H5N8     1 1    
H5N9     6 6    
Total FP 1 1 26 28 1 0
TOTAL GLOBAL 27 15 189 231 2 17

 

Le nombre hebdomadaire de foyers d'IAHP détectés était d'une quinzaine dans les trois premières semaines (semaine 16-48 à 16-50) suivant la détection du premier foyer d'IAHP; à partir de la quatrième semaine, le nombre hebdomadaire de foyers découverts dépasse la vingtaine, pouvant aller jusqu'à 32 foyers découverts en septième semaine (semaine 17-02). Exceptée lors de la troisième semaine (semaine 16-50) pour laquelle 15 foyers d'IAFP ont été détectés, le nombre hebdomadaire de foyers d'IAFP reste inférieur ou égal à 5 (Figure 1).

Figure 1 : Nombre de foyers d'influenza aviaire réglementée détectés en élevages par semaine depuis le 28/11/2017 (date du premier foyer détecté en élevage) et jusqu'au 06/02/2017 à 20h00 (semaine 17-5, en cours). La date considérée est la date de suspicion déclarée à la DGAl lorsqu'elle est connue, et à défaut, c'est la date de confirmation des résultats au LNR qui est considérée (N=231 dont 28 foyers d'IAFP et 203 foyers d'IAHP).

 

Les foyers d'IAHP ont été détectés dans huit départements: la majorité est située dans les départements du Gers (n=86, 42%), des Landes (n=69, 34%) et des Hautes-Pyrénées (n=18, 9%). Les autres foyers sont répartis entre les Pyrénées-Atlantiques (n=9), le Tarn (n=8), le Lot-et-Garonne (n=7), les Deux-Sèvres (n=3), l'Aveyron (n=2) et la Haute-Garonne (n=1) (Tableau 2 et Figure 2).

Les foyers d'IAFP ont été détectés dans cinq départements : le Gers (n=13, 46%), les Landes (n=9, 32%), les Hautes-Pyrénées (n=4, 14%), les Deux-Sèvres (n=1, 4%) et les Pyrénées-Atlantiques (n=1, 4%) (Tableau 2).

Tableau 2 : Répartition du nombre de foyers d'influenza aviaire déclarés au 06/02/2017 à 20h par département.

Département IAHP IAFP Total global
H5Nx H5N8 Total H5Nx H5N1 H5N3 H5N8 H5N9 Total
Aveyron(12) 0 2 2 0 0 0 0 0 0 2
Haute-Garonne(31) 0 1 1 0 0 0 0 0 0 1
Gers(32) 11 75 86 1 7 0 0 5 13 99
Landes(40) 17 52 69 4 3 1 1 0 9 78
Lot-et-Garonne(47) 0 7 7 0 0 0 0 0 0 7
Pyrénées-Atlantiques(64) 3 6 9 0 0 1 0 0 1 10
Hautes-Pyrénées(65) 3 15 18 1 2 0 0 1 4 22
Deux-Sèvres(79) 1 2 3 0 1 0 0 0 1 4
Tarn(81) 1 7 8 0 0 0 0 0 0 8
Total 36 167 203 6 13 2 1 6 28 231

 

Bilan des foyers et cas d'influenza aviaire hautement pathogène (IAHP)

Foyers en élevages domestiques

Une carte interactive de la répartition des foyers et cas d'IAHP est mise à jour dans le cadre de la veille sanitaire internationale (VSI) : pour y accéder, cliquer ici.

Figure 2 : Répartition géographique des foyers et cas d'IAHP déclarés dans le Sud-Ouest au 06/02/2017 à 20h.

 

Suite à la détection du premier foyer d'IAHP, le nombre hebdomadaire de foyers incidents détectés dans les départements du Gers, à partir de la troisième semaine, et des Landes, à partir de la cinquième semaine, est nettement supérieur à celui des autres départements (en moyenne, chaque semaine, 11 foyers incidents sont découverts dans le département du Gers à partir de la 3ème semaine, et 10 foyers incidents sont découverts dans le département des Landes à partir de la 5ème semaine). On observe une augmentation du nombre de foyers incidents pour les départements des Hautes-Pyrénées et des Pyrénées-Atlantiques, respectivement à partir de la 6ème et de la 8ème semaine (semaines 17-01 et 17-03) (Figure 3).

Figure 3 : Nombre cumulé de foyers d'IAHP détectés en élevages par département, depuis le 28/11/2017 (date du premier foyer détecté en élevage) et jusqu'au 06/02/2017 à 20h00 (semaine 17-5, en cours). La date considérée est la date de suspicion déclarée à la DGAl lorsqu'elle est connue, et à défaut, c'est la date de confirmation des résultats au LNR qui est considérée (n=203).

 

Foyers attribués au virus de l'IAHP H5N8

Les 167 foyers déclarés en élevage attribués à l'IAHP H5N8 concernent pour 131 d'entre eux des élevages de palmipèdes, 13 des élevages multi-espèces, et 23 des élevages de galliformes (Tableaux 1 et 3). A l'exception de trois foyers (deux élevages de galliformes et un élevage multi-espèces), tous les élevages découverts infectés et détenant des galliformes l'ont été par la surveillance événementielle (21 élevages de galliformes et 12 élevages multi-espèces). Pour les élevages détenant uniquement des palmipèdes, la surveillance événementielle a permis d'en identifier plus des deux tiers (n=87, 66%). Les autres foyers déclarés en élevage de palmipèdes ont été découverts par des investigations menées sur les liens épidémiologiques à partir des enquêtes épidémiologiques conduites dans les foyers (n=18), par le dépistage lors d'abattages préventifs (n=12), par le dépistage de lots d'animaux avant sortie d'une zone réglementée (n=10), ou par la surveillance menée dans les élevages situés dans les zones de protection (n=4), soulignant l'importance de compléter la surveillance événementielle par d'autres modalités de surveillance. (Tableau 3)

Dans les 87 élevages de palmipèdes découverts infectés par l'IAHP H5N8 au travers de la surveillance événementielle, les taux de mortalité observés lors de la détection des foyers sont variables jusqu'à atteindre 71% (élevage d'oies), soulignant la sensibilité particulière des palmipèdes à ce virus. Dans les élevages de galliformes et multi-espèces, les taux estimés dans les foyers identifiés suite à une suspicion clinique sont extrêmement variables (autour de 1% en général mais atteignant les 100 % dans un élevage de dindons). Cette variabilité est en partie liée à certains biais i) aux différences de délais entre la détection des premiers signes cliniques et l'abattage et ii) au fait que les taux sont parfois calculés sur l'ensemble de la population sensible de l'exploitation et non du lot atteint seulement.

Certains éleveurs signalent le début des signes cliniques 2 à 3 jours avant l’apparition de la mortalité. Les animaux sont apathiques, sans qu’il soit constaté de baisse de consommation d’eau ou d’aliment. Des signes évocateurs sont ensuite généralement observés, avec une prépondérance de signes nerveux qui sont concomitants avec le démarrage de la mortalité. Les animaux sont prostrés, ils présentent des anomalies du port de tête (torticolis) et des difficultés de déplacement (animaux titubants, marche en rond, …). Mais dans certains cas, ces symptômes nerveux sont beaucoup plus frustres et posent la question du diagnostic différentiel avec d’autres pathologies nerveuses, notamment botulisme, pasteurellose, riemerellose. L’administration d’un traitement antibiotique peut aussi diminuer l’expression des signes cliniques. Face à l’observation de cette évolution à bas bruit dans certains élevages et dans le contexte de l’épizootie actuelle, il est rappelé que la vigilance de tous les acteurs de la filière est primordiale.

Tableau 3 : Répartition des foyers découverts en élevages domestiques entre le 26/11/2016 et le 06/02/2017 à 20h00 et attribués à l'IAHP H5N8, selon leur contexte de découverte et l'espèce concernée.

Contexte de découverte Type d'élevage Total
(proportion)
Galliformes Multi-espèces Palmipèdes
Surveillance abattage préventif 0 0 12 12
(7%)
Enquête épidémiologique 1 0 18 19
(11%)
Dépistage avant mouvement d'un lot en sortie de zone 0 1 10 11
(7%)
Surveillance en zone de protection 1 0 4 5
(3%)
Surveillance évènementielle 21 12 87 120
(72%)
Total (proportion) 23 (14%) 13 (8%) 131 (78%) 167

 

Foyers attribués au virus de l'IAHP H5Nx

Concernant les 36 foyers d'IAHP H5Nx en élevage (très vraisemblablement attribuables au virus de l'IAHP H5N8),16 ont été détectés dans le cadre de dépistages lors d'abattages préventifs (tous sur des palmipèdes), 11 dans le cadre de la surveillance évènementielle (huit dans des élevages de palmipèdes, trois dans des élevages de galliformes), quatre dans le cadre d'enquêtes épidémiologiques (tous sur des palmipèdes), deux dans le cadre de dépistages avant mouvement de lots pour la sortie de zone (un sur palmipèdes, un dans un élevage multiespèces), et un dans le cadre de la surveillance en zone de protection (sur des palmipèdes). Pour deux élevages de palmipèdes, l'origine de la suspicion n'était pas connue au moment de l'analyse des données.

Cas dans l'avifaune

Ici, un cas correspond à un ou plusieurs oiseaux trouvés morts sur un même site, le même jour, et confirmés positifs au LNR vis à vis de l'influenza aviaire.

L'unique cas d'IAHP détecté dans l'avifaune captive concernait des canards siffleurs et chipeaux détenus dans le Pas-de-Calais (un cas notifié). Les espèces concernées par les 17 cas d'IAHP détectés dans l'avifaune libre étaient : des buses variables, un faucon crécerelle et une grive musicienne dans le Gers (six cas notifiés), des goélands en Haute-Savoie (deux cas notifiés), des tourterelles turques et des pies dans le Tarn (deux cas notifiés), une buse variable et un héron garde-bœufs dans les Landes (deux cas notifiés), des canards siffleurs dans la Manche (un cas notifié); des cygnes dans l'Ain (un cas notifié); des canards colverts dans le Lot-et-Garonne (un cas notifié), un pigeon ramier dans les Pyrénées-Atlantiques (un cas notifié), et un cygne tuberculé en Loire-Atlantique (un cas notifié). (Tableaux 4 et 5)

Tableau 4 : Cas d'influenza aviaire IAHP détectés dans l'avifaune captive ou libre par département (entre le 26/11/2016 et le 06/02/2017 à 20h00) 

Département Type d'avifaune Total
global
captive libre
H5N8 Total H5N8 H5Nx Total
Ain(01)     1   1 1
Gers(32)     4 2 6 6
Landes(40)       2 2 2
Loire-Atlantique(44)     1   1 1
Lot-et-Garonne(47)     1   1 1
Manche(50)     1   1 1
Pas-de-Calais(62) 1 1     0 1
Pyrénées-Atlantiques(64)       1 1 1
Haute-Savoie(74)     2   2 2
Tarn(81)     2   2 2
Total 1 1 12 5 17 18


Tableau 5 : Liste des espèces (avifaune libre ou captive) ayant fait l'objet de cas confirmés d'IAHP entre le 26/11/2016 et le 06/02/2017 à 20h00

Nom des espèces Type migratoire en France Département Sous-type viral Total
Nom commun Nom latin H5N8 H5Nx
Canard siffleur Anas penelope grand migrateur 50 1   1
Canard colvert Anas platyrhyncos sédentaire 47 1   1
Canard chipeau et Canard siffleur Anas strepera et Anas penelope grand migrateur 62 1   1
Héron garde-boeufs Bubulcus ibis sédentaire 40   1 1
Buse variable Buteo buteo sédentaire 32 3 1 4
40   1 1
Pigeon ramier Columba palumbus grand migrateur 64   1 1
Cygne tuberculé Cygnus olor petit migrateur 44 1   1
Cygne Cygnus spp petit migrateur 01 1   1
Faucon crécerelle Falco tinnunculus sédentaire 32 1   1
Goeland argenté Larus argentatus petit migrateur 74 1   1
Goeland leucophée Larus michaelis petit migrateur 74 1   1
Pie bavarde Pica pica sédentaire 81 1   1
Tourterelle turque Streptopelia decaocto sédentaire 81 1   1
Grive musicienne Turdus philomelos grand migrateur 32   1 1
Total 13 5 18

 

Bilan des foyers d'IAFP en élevage domestique

Les 28 foyers d'IAFP ont tous été détectés en élevage de palmipèdes à l'exception de deux, l'un détecté en élevage de galliformes et l'autre dans un élevage multi-espèces. Ils ont été détectés dans le cadre des dépistages sur des lots d'animaux avant sortie de zone (n=14), d'enquêtes épidémiologiques (n=8), de la surveillance lors d'abattage préventif (n=3), ou de la surveillance en zone de protection (n=1). Pour deux élevages de palmipèdes, l'origine de la suspicion n'était pas connue au moment de l'analyse des données.

Surveillance événementielle conduite dans les élevages de volailles

Les données ci-après concernent les suspicions cliniques issues de la surveillance évènementielle.

Entre le 26 novembre 2016 et le 6 février 2017 à 20h, 215 suspicions ont été recensées dans des troupeaux de volailles domestiques en France ; depuis la dernière note d’information du 23 janvier 2017, 31 suspicions supplémentaires ont été rapportées, essentiellement dans les Landes, le Gers, les Pyrénées-Atlantiques et les Hautes-Pyrénées. Les nouvelles suspicions ont concerné des élevages de palmipèdes (18), de galliformes (8), quatre basses-cours et un élevage de pigeons. Neuf suspicions sont actuellement en cours d'investigation.

La surveillance événementielle a permis d’identifier 131 foyers d’IA HP H5 en élevage ou basse-cour, incluant 120 foyers d’IAHP H5N8 et onze foyers pour lesquels le sous-type de neuraminidase n’a pas pu être identifié, mais vraisemblablement attribuables au virus H5N8 IAHP. Le taux de confirmation des suspicions événementielles atteint 63% (131/206), avec une disparité importante entre les élevages hébergeant des palmipèdes uniquement, où ce taux est de 83% (94/113), et les exploitations hébergeant des galliformes uniquement, ou les basses-cours, qui ont un taux respectif de confirmation de 45% (19/42) et 18% (7/39).

Le taux de confirmation des suspicions cliniques plus élevé chez les palmipèdes que chez les galliformes peut s'expliquer par le fait que les maladies avec manifestations cliniques sont nettement plus courantes en général chez les galliformes que chez les palmipèdes (les palmipèdes sont nettement moins sensibles en termes de clinique en général aux agents pathogènes).

Figure 4 : Nombre de suspicions issues de la surveillance évènementielle d’IA confirmées, infirmées ou en cours d’analyse entre le 26/11/2016 (date de déclaration de la suspicion du premier cas d'IAHP à la DGAl) et le 06/02/2017 à 20h00 (semaine 17-06 encours) (n= 215 suspicions dans des troupeaux de volailles domestiques en France)

 

Tableau 6 : Nombre de suspicions issues de la surveillance événementielle confirmées, infirmées ou en cours d’investigation par type de production entre le 26/11/2016 et le 06/02/2017 à 20h00 (n=215 suspicions dans des troupeaux de volailles domestiques en France)

Production Confirmée HP Infirmée Total En cours
Palmipèdes 94 19 113 6
Galliformes 19 23 42 0
Palmipèdes et galliformes 11 0 11 1
Columbiformes 0 1 1 0
Basses-cours ou ornement 7 32 39 2
Total 131 75 206 9


Surveillance de la faune sauvage

Surveillance événementielle de la faune sauvage

Modalités de la surveillance événementielle

Cette surveillance s'appuie en priorité sur le réseau Sagir, réseau permanent de surveillance syndromique des mortalités d’oiseaux et des mammifères sauvages terrestres en France, co-animé par l'Office national de la chasse et de la faune sauvage (ONCFS) et la Fédération nationale des chasseurs (FNC).

Il s'agit, au travers de ce réseau, de collecter les cadavres d'oiseaux considérés d'intérêt vis-à-vis de l'influenza aviaire, sur des territoires accessibles à tous, et en particulier aux chasseurs.

Dès que le niveau de risque a été augmenté pour atteindre le niveau modéré, et plus encore lorsqu'il a atteint le niveau élevé, la surveillance événementielle de la mortalité dans la faune sauvage a été renforcée sur l'ensemble du territoire.

Pour renforcer ce dispositif :

- la vigilance des acteurs impliqués dans le réseau Sagir a été renforcée : la consigne a été donnée aux acteurs habituels (chasseurs, agents des fédérations départementales de la chasse et des services départementaux de l'ONCFS) d'intensifier la collecte de cadavres selon les critères suivants :

1. prélèvement systématique des cadavres d'oiseaux d'eau (dès le premier trouvé pour les espèces suivantes : cygnes, canards, oies (anatidés), mouettes, goélands (laridés), poules d'eau, foulques, râles (rallidés))

2. prélèvement sur appréciation locale pour les autres espèces, avec un encouragement à procéder à des analyses à partir de trois oiseaux trouvés morts de la même espèce, sur le même lieu, dans un délai court (moins d'une semaine)

- le territoire de collecte habituel de Sagir a été étendu aux réserves naturelles, qui mobilisent leurs agents pour détecter les cadavres et les intègrent ensuite au réseau Sagir. Les critères de sélection des espèces sont identiques au protocole général.

- les centres de sauvegarde, qui recueillent des oiseaux malades, ainsi que les cabinets vétérinaires volontaires, sont également intégrés dans la surveillance événementielle, avec un critère supplémentaire de sélection des oiseaux : on s’intéresse également aux accipitridés et aux faucons pélerins (rapaces diurnes mangeurs d’oiseaux, et de ce fait potentiellement contaminés, comme il a pu être déjà observé en Europe et sur le territoire national).

Résultats de la surveillance événementielle

Répartition par famille

Parmi les 550 oiseaux collectés depuis le 1er novembre 2016, 23 familles sont représentées. Les plus représentées sont celles des Anatidés (n=175) et des Colombidés (n=147). Les cas détectés positifs vis à vis de l'influenza aviaire ont été détectés dans huit familles différentes (Figure 5).

Figure 5 : Répartition du nombre d'oiseaux collectés et de ceux ayant été confirmés séropositifs vis à vis de l'influenza aviaire, par famille (n =550), depuis le 1er novembre 2016.