Epidémiosurveillance en santé animale

Point de situation de l'IAHP en France au 19/12/2016 et bilan des actions de surveillance

Marie-Cécile Moisson (1), Didier Calavas (2)*, Manon Hamon (1), Axelle Scoizec (3), Anne Van-de-Wiele (4), Eva Faure (5), Anne Bronner (1)*

(1) DGAl, (2) Anses-Lyon, (3) Unité Epidémiologie, Anses-Ploufragan, (4) ONCFS, (5) FNC

* Coordination Plateforme ESA

Au total, depuis le 26 novembre 2016, ce sont 36 foyers en élevage et quatre cas dans l’avifaune (un sur des oiseaux captifs, trois sur oiseaux sauvages) d'influenza aviaire hautement pathogène qui ont été déclarés en France, tous étant formellement liés à H5N8 à l'exception d'un foyer en élevage (H5HP) pour lequel la neuraminidase n'a pas pu être identifiée (Figure 1).

Figure 1 Carte des foyers H5N8 déclarés en France

Figure 1 : Carte des foyers H5N8 déclarés en France, entre le 26/11/2016 et le 19/12/2016

Bilan des foyers IAHP H5N8

Foyers en élevages domestiques (Tableau 1)

Les 36 foyers déclarés en élevage concernent pour 29 d'entre eux des élevages de palmipèdes, six des élevages multi-espèces (détenant des galliformes et des palmipèdes), et un des galliformes.

Le contexte de découverte de ces foyers est le suivant :

- 18 foyers ont été détectés dans le cadre de la surveillance événementielle, dont 11 élevages de palmipèdes, six élevages multi-espèces et un élevage de galliformes ;

- 13 foyers ont été détectés en lien épidémiologique avec un foyer confirmé (dont le foyer H5HP), incluant le lien par voisinage, tous étant des élevages de palmipèdes ;

- deux foyers ont été détectés dans le cadre de dépistage avant sortie de zone réglementée - tous étant des élevages de palmipèdes (suspicion analytique) ;

- trois foyers ont été détectés dans le cadre de la surveillance menées dans les zones de protection (ZP, 3km) mises en place autour des foyers - tous étant également des élevages de palmipèdes.

Parmi ces foyers, 15 sont situés dans le département du Gers, 7 dans le département du Tarn, 6 dans le département du Lot-et-Garonne, 2 dans les Pyrénées-Atlantiques, 1 dans le département des Hautes-Pyrénées, 2 dans l'Aveyron et 3 dans les Landes.

Dans les élevages de palmipèdes, les taux de mortalité observés lors de la détection des foyers sont variables mais peuvent atteindre 18 %, soulignant la sensibilité particulière des palmipèdes à ce virus. Dans les élevages de galliformes et multi-espèces, les taux estimés dans les foyers identifiés par suspicion clinique sont faibles (autour de 1%, sur l'ensemble de la population sensible). Ces taux sont à considérer avec précaution : d'une part, le pas de temps sur lequel les mortalités ont été observées est variable, ils correspondent parfois à une mortalité observée entre la date d'apparition des premiers critères d'alerte et la date de déclaration de la suspicion, ces taux sont parfois calculés sur l'ensemble de la population sensible de l'exploitation (et non du lot atteint) faute de précision, et peuvent de ce fait être sous-estimés.

Sur le plan lésionnel, des aéro-sacculites rares et peu marquées, une splénomégalie d'intensité très variable, une congestion de l'encéphale (difficile à identifier), une pancréatite et une myocardite quasi-systématique et très sévère ont été observées dans les deux premiers foyers du Tarn (communication personnelle du Pr J-L Guérin).

Tableau 1 : Caractéristiques des foyers primaires et secondaires d'IAHP déclarés en élevage en France entre le 26/11/16 et le 19/12/16 (n = 36)

INSEE COMMUNE Espèce Mortalité

(nb de morts / nb total d'animaux)
Type de suspicion Origine de la suspicion Date de

Confirmation au LNR
12278 TAYRAC multi-espece2 NR clinique évènementielle 12/12/16
12278 TAYRAC multi-espece2 nr clinique évènementielle 17/12/16
32022 AVERON BERGERELLE palmipèdes 9 % (72/800) clinique évènementielle 14/12/2016
32037 BEAUMONT/LOSSE palmipèdes1 14 % (100/690) enquête lien épidémio *
32094 CAUPENNE D'ARMAGNAC palmipèdes NR clinique évènementielle 14/12/2016
32119 EAUZE palmipèdes 11 % (100/900) clinique évènementielle 14/12/16
32119 EAUZE palmipèdes1 6 % (100/1640) enquête lien épidémio *
32202 LAUJUZAN palmipèdes NR clinique événementielle 17/12/16
32229 MANSEMPUY palmipèdes NR analytique lien épidémio 15/12/16
32243 MAULEON D'ARMAGNAC palmipèdes NR clinique événementielle 15/12/16
32274 MONLEZUN D'ARMAGNAC palmipèdes NR analytique sortie de zone 19/12/16
32274 MONLEZUN palmipèdes1 <1 % (100/15600) enquête lien épidémio *
32342 RICOURT multi-espece2 <1 % (100/21200) clinique évènementielle 09/12/16
32394 SAINT MEDARD palmipèdes 0%

(0/2000)
analytique lien épidémio 17/12/16
32424 SEGOS multi-espece2 NR clinique évènementielle 14/12/2016
32424 SEGOS palmipèdes NR enquête lien épidémio 13/12/2016
32446 TILLAC palmipèdes NR clinique événementielle 19/12/16
40080 CAZERES SUR L'ADOUR palmipèdes NR analytique lien épidémio 18/12/16
40097 EUGENIE LES BAINS palmipèdes 12 % (114/950) clinique évènementielle 14/12/2016
40166 LUSSAGNET palmipèdes 7 %

(672/9600)
clinique lien épidémio 16/12/2016
47170 MONBAHUS palmipèdes 5 % (70/1300) analytique surveillance ZP 11/12/16
47170 MONBAHUS palmipèdes 0 % (0/2200) analytique surveillance ZP 09/12/16
47170 MONBAHUS palmipèdes 4 % (70/2000) clinique surveillance ZP 11/12/16
47170 MONBAHUS palmipèdes 0,3%

(13/4000)
clinique événementielle 18/12/16
47170 MONBAHUS palmipèdes1 10 % (200/1950) enquête lien épidémio *
47170 MONBAHUS palmipèdes 0 %

(0/2000)
enquête lien épidémio 04/12/2016
64216 ESPOEY palmipèdes NR analytique sortie de zone 14/12/2016
64238 GER3 palmipèdes NR analytique lien épidémio 13/12/2016
65226 IBOS palmipèdes1 0 % (0/1000) enquête lien épidémio *
81008 ALMAYRAC palmipèdes 18 % (917/5143) clinique évènementielle 02/12/2016
81008 ALMAYRAC palmipèdes 5 % (300/6120) clinique évènementielle 04/12/2016
81123 LACAPELLE SEGALAR palmipèdes <1 % (3/13500) clinique évènementielle 05/12/16
81170 MONESTIES palmipèdes 0 % (0/1000) analytique lien épidémio 08/12/2016
81170 MONESTIES multi-espece2 1 % (150/14900) clinique évènementielle 07/12/2016
81170 MONESTIES galliformes <1 % (50/7000) clinique évènementielle 08/12/2016
81191 MOUZIEYS PANENS multi-espece2 <1 % (10/3010) clinique évènementielle 07/12/2016

 1Ces élevages ont reçu des animaux du deuxième élevage infecté dans le Tarn juste avant l’adoption des mesures correspondant au premier foyer, ils ont fait l'objet d'abattages préventifs. 

2Dans ces élevages, l'espèce atteinte n'a pas été renseignée.

 

Cas dans l'avifaune (Tableau 2)

Les quatre cas détectés dans la faune sauvage concernaient pour l’un la faune sauvage captive sur des canards appelants dans le département du Pas-de-Calais (62), pour trois autres la faune sauvage libre : deux goélands en Haute-Savoie (74) et quatre tourterelles turques dans le Tarn (81). Tous ont été identifiés par la surveillance événementielle.

Tableau 2 : Caractéristiques des cas confirmés IAHP H5N8 dans l'avifaune captive et libre en France entre le 26/11/16 et le 19/12/16 (n=4)

Code INSEE Nom de commune Espèce

(nom latin)
Type d'avifaune Effectif

(Tx de mortalité)
Date de déclaration officielle Date de

Confirmation

Au LNR
62548 MARCK Canards chipeaux et siffleurs

(Anas strepera et Anas penelope )
captive

(appelants)
75

(33 %, 25/75)
28/11/2016 26/11/2016
74119 EVIAN Goeland

(Larus spp)
libre 1

(so)
02/12/2016 02/12/2016
74081 CLUSES Goeland

(Larus spp)
libre 1

(so)
12/12/2016 12/12/2016
81325 VIVIERS LES MONTAGNES Tourterelles turques

(Streptopelia decaocto)
libre 4

(so)
13/12/2016 13/12/2016

 

Surveillance événementielle conduite dans les élevages de volailles

Au total, depuis le 23 novembre, 55 suspicions cliniques ont été recensées chez des oiseaux domestiques : 19 concernaient des élevages de galliformes, 21 des élevages de palmipèdes, 13 des élevages multi-espèces (espèce atteinte non renseignée), 1 des mandarins, 1 un élevage de pigeons (Tableau 3, espèce « autre »). Ces suspicions cliniques ont été émises dans 24 départements, la plupart dans les départements ayant déclaré des foyers (11 dans le Tarn, 15 dans le Gers, 3 dans les Landes, 2 dans l'Aveyron, 1 en Haute-Savoie, 2 dans les Pyrénées-Atlantiques, 1 dans l'Aube, mais également la Charente-Maritime (1), la Dordogne (1), le Doubs (1), l'Eure-et-Loir (1), le Finistère (2), la Gironde (1), le Loiret (1), le Morbihan (1), la Haute-Saône (2), la Somme (1), le Vaucluse (1), la Vendée (1), la Vienne (1), la Corrèze (1), la Haute-Garonne (1), la Loire (1) et le Lot-et-Garonne (1).

Tableau 3 : Bilan des suspicions cliniques d'influenza aviaire en élevage selon les espèces concernées entre le 23/11/16 et le 19/12/16

  Statut de la suspicion Total Taux de confirmation
Espèces de l'élevage confirmé infirmé en cours abattage préventif
Palmipèdes 11 4 6   21 73%
Galliformes 1 16 2   19 6%
Multi-espèces 7 5   1 13 58%
Autre   2     2 0%
Total 19 27 8 1 55 41%

 

Surveillance programmée conduite dans les élevages de volailles

Des zones de protection (ZP, 3km) et de surveillance (ZS, 10km) ont été mises en place autour de chaque foyer. Dès la mise en place d'une zone de protection, tout site d'élevage situé dans le périmètre doit faire l'objet d'une visite clinique par un vétérinaire sanitaire. Les élevages de palmipèdes, ainsi que les basse-cours situées à proximité d'un foyer ou considérées comme particulièrement à risque font l'objet d'un dépistage virologique systématique.

 

Au sein des zones de protection, ce sont 682 ateliers de volailles qui sont recensés dont 390 ateliers de palmipèdes et 247 ateliers de galliformes(Tableau 4). Au sein des zones de surveillance, ce sont 2677 ateliers de volailles qui sont recensés, dont 390 ateliers de palmipèdes et 247 ateliers de galliformes (Tableau 5).

Tableau 4 : Nombre d'ateliers recensés dans les zones de protection, selon le type de production et par département

DEPARTEMENT Galliformes Palmipèdes Autre
12 7 1 0
32 128 205 18
40 47 123 3
47 7 36 0
64 4 7 0
65 4 1 0
81 50 17 2
Total 247 390 23

 

Tableau 5 : Nombre d'ateliers recensés dans les zones de surveillance, selon le type de production et par département

DEPARTEMENT Galliformes Gibier Palmipèdes Autre
12 17 0 8 2
32 460 1 630 41
40 276 0 532 25
47 121 1 75 6
64 62 1 87 11
65 39 0 42 3
81 37 0 13 1
82 1 0 6 0
Total 1013 3 1393 89

 

Surveillance de la faune sauvage libre

Modalités de surveillance événementielle

Dès que le niveau de risque a été augmenté pour atteindre le niveau modéré, et encore plus au niveau élevé, la surveillance événementielle des mortalités de la faune sauvage a été renforcée sur l 'ensemble du territoire.

En ce sens, la vigilance des acteurs impliqués dans le réseau Sagir a été renforcée. Sagir est le réseau commun permanent de surveillance syndromique des mortalités d’oiseaux et des mammifères sauvages terrestres en France, co-animé par l'ONCFS et la FNC. En l'occurrence, il s'agit, au travers de ce réseau, de collecter les cadavres d'oiseaux considérés d'intérêt vis-à-vis de l'influenza aviaire, sur des territoires accessibles à tous, et en particulier aux chasseurs.

Pour renforcer ce dispositif :

- la consigne a été donnée aux acteurs habituels (chasseurs, agents des fédérations départementales de la chasse et des services départementaux de l'ONCFS ) d'intensifier la collecte de cadavres, en suivant les critères suivants :

  • prélèvement systématique des cadavres d'oiseaux d'eau (dès le premier trouvé pour les espèces suivantes: cygnes, canards, oies (anatidés), mouettes, goélands (laridés), poules d'eau, foulques, râles (rallidés)),
  • prélèvement sur appréciation locale pour les autres espèces, avec un encouragement à procéder à des analyses à partir de trois oiseaux trouvés morts de la même espèce, sur le même lieu, dans un délai court (moins d'une semaine)

- le territoire de collecte habituel de Sagir a été agrandi aux réserves naturelles, qui mobilisent leurs agents pour détecter les cadavres et les intègrent ensuite au réseau Sagir. Les critères de sélection des espèces sont identiques au protocole général.

- les centres de sauvegarde, qui recueillent des oiseaux malades, ainsi que les cabinets vétérinaires volontaires, sont également intégrés dans la surveillance événementielle, avec un critère supplémentaire de sélection des oiseaux : on s’intéresse également aux accipitridés (rapaces diurnes mangeurs d’oiseaux, et de ce fait potentiellement contaminés, comme il a pu être déjà observé en Europe).

Résultats de la surveillance événementielle

Répartition géographique

Entre le 1er novembre et le 16 décembre 2016, 240 oiseaux morts ont été collectés. Les résultats sont pour l’instant disponibles pour 174 d’entre eux, et 64 sont en cours d'analyse. Parmi les 174 résultats disponibles, la commune était identifiée pour 145 d'entre eux (Figures 3 et 4). Après les 4 canards appelants du  Pas-de-Calais (62), deux goélands spp (Larus spp) en Haute-Savoie (74) se sont révélés positifs vis-à-vis de l’influenza aviaire de type H5N8 au LNR les 2 et 12 décembre, ainsi que 4 tourterelles turques (Streptopelia decaocto) et 3 pies bavardes (Pica pica) dans un des foyers du Tarn (81).

Répartition par famille

La répartition montre que les familles ciblées par la surveillance évènementielle sont bien représentées (Figure 4). La famille la plus fréquemment collectée est celle des columbidés, qui sont aussi les plus proches des lieux de vie humaine.

 

Figure 3 : Premiers résultats des oiseaux collectés par le réseau Sagir depuis le 1er nov 2016 (n = 145)

En rouge : les cas positifs. En orange : les cas négatifs. En gris: communes en zone humide.

Figure 3 Premiers résultats des oiseaux collectés par le réseau Sagir depuis le 1er nov 2016

Figure 4 : Nombre d'oiseaux collectés par famille, depuis le  1er nov 2016 (n = 145)

Figure 4 Nombre d'oiseaux collectés par famille, depuis le  1er nov 2016

* familles particulièrement visées par le protocole

 

Surveillance programmée de l'avifaune

Cette surveillance est basée sur la clinique et la recherche des mortalités, au cours de visites programmées. Dix sites de concentration des oiseaux migrateurs ont été sélectionnés sur le territoire métropolitain, où il est demandé aux observateurs de terrain de pratiquer une surveillance régulière, et de rapporter l'état des populations d'oiseaux migrateurs et des mortalités observées. En cas de détection de cadavre, il rejoint alors le réseau Sagir (Figure 5). Les résultats de ce protocole seront présentés dans une publication ultérieure.

Figure 5 : Zones de surveillance programmée en Influenza aviaire sur les oiseaux migrateurs

En rouge : sites spécifiques pour les fuligules morillons.

En violet : concentration d'oiseaux d'eau migrateurs (plusieurs espèces)

 

Figure 5 Zones de surveillance programmée en Influenza aviaire sur les oiseaux migrateurs