Que sait-on des espèces de Culicoïdes associées à la faune sauvage en région tempérée européenne ? Synthèse des données de la littérature

Pour l’UMR ASTRE du Cirad : Claire Garros, Thomas Balenghien

Pour l’OFB : Stéphanie Desvaux

Pour le comité de rédaction de la Plateforme ESA : Jean-Philippe Amat, Eric Cardinale, Sophie Carles, Julien Cauchard, Céline Dupuy, Guillaume Gerbier, Viviane Hénaux, Célia Locquet, Sophie Molia, Carlène Trévennec, Sylvain Villaudy.

Auteur correspondant : plateforme-esa@anses.fr

Le genre Culicoides rassemble des espèces de petits moucherons, cosmopolites en région tempérée et responsables de la transmission d’orbiviroses aux ruminants sauvages et domestiques, dont la fièvre catarrhale ovine (FCO) et la maladie épizootique hémorragique (MHE ou EHD en anglais).

Le cycle de développement des espèces implique des stades immatures (de l’œuf à la nymphe) se développant dans des substrats humides riches en matière organique d’origine végétale ou animale et un stade adulte évoluant dans le milieu aérien. Les larves des Culicoides peuvent être retrouvées dans une grande variété d’habitats : principalement dans la vase ou les boues qui entourent les collections d’eau (de la flaque au lac), les bords de rivières, ruisseaux ou tourbières, mais aussi les bouses ou les litières humides des grands vertébrés ou encore les trous d’arbre et les végétaux en décomposition. Si les habitats larvaires hébergent généralement des communautés d’espèces, les caractéristiques du milieu (salinité, pH, quantité de matière organique d’origine animale ou végétale, etc.) déterminent leurs compositions.

Dans les élevages de la région paléarctique, les larges zones boueuses, chargées en matière organique d’origine animale (urine, fèces) et piétinées par les animaux, sont identifiées comme des habitats larvaires préférentiels pour les espèces associées aux ruminants d’élevage. Parmi ces espèces, certaines sont cependant ubiquistes. Ainsi, les larves de C. obsoletus, espèce abondante et largement distribuée en région paléarctique (carte vectornet), sont capables de se développer dans les litières de forêt, dans des trous d’arbre, dans des résidus d’ensilage de maïs ou dans du fumier en voie de compostage. Cette grande plasticité permet à cette espèce d’être présente dans presque tous les milieux de son aire de distribution, quel que soit le type de sol, du niveau de la mer à plus de 2 000 m d’altitude, en pleine forêt ou dans des habitats anthropisés comme les élevages. A l’inverse, d’autres espèces peuvent être inféodées à un certain type d’hôte et d’habitat larvaire. Par exemple, C. chiopterus est associé aux bovins et les bouses sont les habitats larvaires de cette espèce. Les espèces de Culicoides classiquement reconnues comme vectrices de virus d’intérêt pour les ruminants domestiques en région paléarctique tempérée non-méditerranéenne (virus de la FCO, virus de Schmallenberg) sont : C. obsoletus, C. scoticus, C. chiopterus, C. dewulfi, C. pulicaris, C. punctatus, C. lupicaris, et C. newsteadi. D’autres espèces sont décrites comme ornithophiles.

Les données sur les communautés d’espèces de Culicoides paléarctiques associées à la faune sauvage sont rares. Une revue non exhaustive de la littérature la plus récente a été réalisée en ciblant les régions européennes partageant les mêmes communautés d’espèces que celles décrites en France. Ces suivis entomologiques ont été réalisés dans des environnements naturels permettant de caractériser la diversité et les abondances spécifiques, parfois les dynamiques des populations. Certains suivis ont permis d’analyser moléculairement les repas de sang des femelles capturées gorgées.

• Article 1 : Communautés d’espèces dans les écosystèmes aquatiques en Espagne (González et al. 2022)

Un suivi entomologique a été réalisé dans deux réserves naturelles (Urdaibai et Salburua) dans la région du Pays Basque, au nord de l’Espagne. Ces réserves sont connues comme zones d’hivernage ou d’arrêt pour les oiseaux migrateurs. Dans chaque réserve, cinq sites ont été suivis entre le 01/07 et le 31/10/2018 (2 sites) et le 01/05 et le 31/10/2019 (3 sites). Les piégeages ont été réalisés avec des pièges lumineux de type CDC appâtés avec de la carboglace, posé 24 h, toutes les deux semaines.

Un total de 4 945 Culicoides a été collecté sur les dix sites représentant 28 espèces. La diversité était dominée par cinq espèces ornithophiles, C. alazanicus (n = 1 238, 24,9 %), C. griseidorsum (n = 1 012, 20,3 %), C. poperinghensis (n = 808, 16,2 %), C. kibunensis (n = 531, 10,7 %) et C. clastrieri (n = 479, 9,6 %). Les espèces C. obsoletus, C. scoticus et C. dewulfi étaient également présentes dans les deux réserves mais plus rares (pour les 3 espèces, n = 66, 1,3 %). La dynamique était univoltine, avec un pic au début de l’été.

L’analyse des repas de sang (53 individus pour 8 espèces) a montré que des espèces ornithophiles (C. griseidorsum et C. poperinghensi) peuvent se gorger sur des mammifères sauvages et inversement, que des espèces mammophiles (C. obsoletus) peuvent prendre un repas de sang sur des oiseaux. Les repas pris sur mammifères sauvages étaient dominés par Cervus elaphus puis Sus scrofa.

• Articles 2 et 3 : Communautés d’espèces chez les ruminants domestiques et sauvages en Espagne (Talavera et al. 2018 ; Talavera et al. 2015)

Un suivi entomologique dans sept sites avec des communautés de ruminants sauvages importantes a été réalisé entre 2009 et 2010 (juillet à novembre) en Espagne. A chaque site de piégeage (localisé à plus d’1 km d’un élevage de ruminants domestiques), trois pièges à lumière noire ont été installés et mis en action pour trois nuits consécutives de capture, une fois par mois. Les données de diversité et d’abondance dans les élevages domestiques les plus proches étaient issues des données du réseau de surveillance des populations de Culicoides espagnol.

Un total de 102 693 spécimens ont été capturés représentant 40 espèces. Le nombre moyen d’espèces est supérieur dans les sites de ruminants sauvages (18) comparés aux sites de ruminants domestiques (13). Au moins une espèce d’intérêt vétérinaire (C. imicola, ou espèces des « groupes » Obsoletus ou Pulicaris) était présente à chaque site de capture.

Les communautés d’espèces aux sites avec des ruminants sauvages et domestiques étaient similaires (analyses de similarités (ANOSIM), global R = 0,175, p = 0,250), indiquant que la présence d’hôtes n’affecte pas la composition d’espèces des communautés.

Un total de 264 femelles gorgées, issues du suivi entomologique décrit ci-dessus, a été analysé afin d’identifier l’origine des repas de sang. Un total de 114 repas de sang a pu être identifié pour quatorze espèces de Culicoides dont C. obsoletus, C. scoticus, C. punctatus et C. imicola. Douze hôtes ont été identifiés (6 espèces de mammifères et 6 espèces d’oiseaux). Pour les repas de sang pris sur mammifères, les hôtes les plus fréquents étaient le cerf élaphe (C. elaphus, 66,7 %), l’espèce humaine (Homo sapiens, 13,0 %) et le daim européen (Dama dama, 6,1 %).

• Article 4 : piégeages en zone forestière en Lituanie (Bernotienė et al. 2021)

Un suivi entomologique a été réalisé dans le parc régional de Verkiai dans le nord de Vilnius, Lituanie. Ce parc est largement forestier, sans présence de ruminant domestique mais avec des communautés riches d’oiseaux et de mammifères sauvages. Des pièges à lumière noire de type OVI ont été posés en hauteur, une nuit/semaine de fin avril à mi-octobre en 2016 et 2018, et d’avril à juin en 2019, pour un total de 52 nuits de captures.

Un total de 7 332 femelles représentant 22 espèces a été capturé. Les espèces les plus abondantes, quelle que soit l’année, étaient C. obsoletus et les autres espèces du Groupe Obsoletus, puis C. kibunensis et C. impunctatus. Culicoides punctatus et C. chiopterus présentaient des abondances fortes certaines années. Le pic d’abondance a été observé en juin.

• Article 5: Communautés d’espèces en France (Rossi et al. 2019)

En France, un suivi entomologique a été réalisé entre juin et fin août 2008 dans cinq régions connues pour la présence importante de faune sauvage (Alsace, Bourgogne, Pyrénées, Alpes et Haut-Languedoc). Dans chaque département, un à dix sites ont été échantillonnés avec un piège à lumière noire de type OVI (1 à 4 nuits de capture consécutives). Les données de diversité et d’abondance des fermes les plus proches étaient issues du réseau de surveillance des populations de Culicoides français.

Un total of 51 380 Culicoides représentant au moins 30 espèces a été capturé. Les espèces les plus abondantes dans les sites naturels étaient C. obsoletus s.l./C. scoticus (59,1 %), C. furcillatus (17,7 %), C. achrayi (7,8 %), C. punctatus (6,1 %), C. pallidicornis (3,2 %), C. kibunensis (1,5 %), et C. festivipennis (1,5 %). Dans les cinq fermes sélectionnées, les espèces les plus abondantes étaient C. obsoletus s.l./C. scoticus (76,3 %), C. chiopterus (4,9 %), C. achrayi (2,9 %), C. pulicaris (2,6 %), C. lupicaris (1,9 %), C. dewulfi (1,4 %), et C. vexans (1,4 %).

Un total de 70 femelles gorgées a été identifié : dix sur bovins Bos taurus, six sur ovins Ovis aries ou mouflon Ovis musimon, cinq sur chevaux Equus caballus, neuf sur cerf élaphe Cervus elaphus, deux sur chevreuil Capreolus capreolus, un sur chamois Rupicapra rupicapra, et deux sur oiseau (genre Sylvia). Deux espèces, C. obsoletus et C. achrayi, ont été retrouvées gorgées à C. elaphus.

Références

Bernotienė, Rasa, Galina Bartkevičienė, et Dovilė Bukauskaitė. 2021. « The Flying Activity of Biting Midges (Ceratopogonidae: Culicoides) in Verkiai Regional Park, Southeastern Lithuania ». Parasitology Research 120 (7): 2323‑32. https://doi.org/10.1007/s00436-021-07147-2.

González, Mikel A., Fátima Goiri, Sean W. J. Prosser, Aitor Cevidanes, Luis M. Hernández-Triana, Jesús F. Barandika, Paul D. N. Hebert, et Ana L. García-Pérez. 2022. « Culicoides species community composition and feeding preferences in two aquatic ecosystems in northern Spain ». Parasites & Vectors 15 (1): 199. https://doi.org/10.1186/s13071-022-05297-5.

Rossi, Sophie, Thomas Balenghien, Cyril Viarouge, Eva Faure, Gina Zanella, Corinne Sailleau, Bruno Mathieu, et al. 2019. « Red Deer (Cervus Elaphus) Did Not Play the Role of Maintenance Host for Bluetongue Virus in France: The Burden of Proof by Long-Term Wildlife Monitoring and Culicoides Snapshots ». Viruses 11 (10): 903. https://doi.org/10.3390/v11100903.

Talavera, S., F. Muñoz-Muñoz, M. Verdún, N. Pujol, et N. Pagès. 2018. « Revealing Potential Bridge Vectors for BTV and SBV: A Study on Culicoides Blood Feeding Preferences in Natural Ecosystems in Spain ». Medical and Veterinary Entomology 32 (1): 35‑40. https://doi.org/10.1111/mve.12263.

Talavera, Sandra, Francesc Muñoz-Muñoz, Mauricio Durán, Marta Verdún, Anna Soler-Membrives, Álvaro Oleaga, Antonio Arenas, Francisco Ruiz-Fons, Rosa Estrada, et Nitu Pagès. 2015. « Culicoides Species Communities Associated with Wild Ruminant Ecosystems in Spain: Tracking the Way to Determine Potential Bridge Vectors for Arboviruses ». PLOS ONE 10 (10): e0141667. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0141667.

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